万叶灵根系统的入口位于极北村庄的最下方，进入到灵根系统的主页面之后点击屏幕左上角的问号图标就可以查看该系统的详细玩法。首先就是开启万叶灵根系统必须要将角色当前的战斗力提升至200万及以上，然后就会极北村庄的最下方开启灵根系统的入口。万叶灵根一共包括九种不用的灵根，比如天根、金根、月根以及时根等，可以同时对这些灵根进行培养。
每一种两根都被划分为不同的境界以及品阶，对这些灵根进行培养之后就可以提升该灵根的破灭力以及御身力，从而进一步提高该灵根的灵根值以及万叶灵根的总灵根值。当你进入到任意类型的副本挑战或者PK模式的对局中，灵根的破灭力、御身力以及万叶领很系统中的总灵根值，都会对角色释放出来的主动以及被动仙术的实战效果产生较大幅度的影响。并且角色的仙术对怪物造成的伤害量、减益效果以及持续的时间都与总灵根值成正比，同时还可以对角色当前的总战斗力产生一定的影响。
把角色当前的灵根培养到一定境界之后，就会激活灵根元石装配、元素降福效果以及元素之灵这些心的玩法。一旦开启万叶灵根系统，极北地图中的所有关卡都会开启混沌副本的灵狱模式，同时也包括极北地图中的极寒深渊。在灵狱模式中遇到的小怪以及boss比常规模式的怪物要更难对于，因为在该模式的关卡中额外增加了灵气环境，当角色处于灵气环境下就会受到不同程度负面效果的干扰。但是在顺利击败最终的boss之后就可以免费获取到更加丰富的混沌奖励，同时还可以拿到很多用于培养灵根的道具。
