三国志战略版夏侯惇的主要缺点集中在输出机制限制、惧怕谋略伤害、容易被当锋摧决克制、阵容搭配局限性强，同时后期单刷能力下滑，对战法和特定武将的依赖性很高，环境适配面比较狭窄。
夏侯惇的核心输出完全绑定受击反击机制，自带战法刚烈不屈只有在承受兵刃伤害时才能够触发反击，敌方普攻、兵刃攻击越少，他的整体输出就越低。面对以谋略输出为主的队伍，敌方多数伤害属于法术伤害，不会触发夏侯惇的反击效果，即便自身统率再高，也只能发挥坦度，很难打出可观伤害，碰到麒麟弓、魏智这类法系阵容时，经常出现战报数据惨淡的情况。实战当中即便搭配气凌三军、绝地反击等反击类战法，依旧改变不了输出触发的前提条件，队伍如果无法稳定吸引敌方兵刃攻击，夏侯惇就会沦为单纯的肉盾，缺少主动制造伤害的手段。开荒阶段单刷面对谋略型守军，战损会明显飙升，高级土地里的谋略武将很容易造成大量兵力损耗，需要频繁侦查规避，操作成本会随之上升。
当锋摧决是夏侯惇体系的一大克星，该突击战法可以禁用被动、指挥战法，一旦命中夏侯惇，刚烈不屈以及携带的各类反击战法会直接失效，直接废掉整套队伍的输出逻辑。即便队伍配置草船借箭，也只能做到概率解除负面，无法百分百规避当锋摧决带来的压制效果，遇到携带当锋摧决的武将，整支队伍的作战能力会出现断崖式下跌。弯弓饮羽这类降低属性的战法同样会带来麻烦，降低统率之后，不仅夏侯惇承伤能力下降，反击的触发概率也会被削弱，进一步压缩他的实战上限。
夏侯惇自身没有自带嘲讽效果，想要稳定承接伤害，要么携带嘲讽类战法，要么依赖满宠的援护机制，阵容组建的门槛被拉高。缺少满宠时，夏侯惇很难稳定吃到敌方攻击，反击输出断断续续，队伍强度会大打折扣，这也让他的可用阵容选择变少，大多局限于魏盾体系，很难灵活混搭其他阵营武将。同时他的武力成长并不突出，反击伤害上限有限，面对高减伤的肉队，很容易出现输出刮痧，长时间拉锯下难以快速压低敌方兵力，容易被续航型队伍慢慢耗死。很多玩家使用夏侯惇开荒之后，会面临转型难题，单刷模式到中后期不再适用，直接放进主流强队又很难卡位，要么专门组建反击盾，要么只能沦为碰瓷工具武将，资源投入的回报效率不算高。
在实战配队时，想要弥补夏侯惇的短板，需要在队伍里补充谋略输出副将，用来处理法系对手，同时预留草船借箭这类解控战法，用来应对当锋摧决的压制，还要保证援护、嘲讽手段到位，保障夏侯惇稳定承受兵刃伤害。但这些配置会占用大量核心战法与武将资源，对于武将、战法储备不足的玩家，强行组建夏侯惇队伍，很容易出现强度不足的问题，很难做到通吃各类战场环境，只适合兵刃队伍较多的对局环境，遇到法系、突击队伍需要主动避战。
