诸葛亮在游戏少年三国志中的结局与历史一致，病逝于五丈原。作为蜀汉丞相，诸葛亮在第五次北伐期间与司马懿对峙于五丈原，最终因积劳成疾而亡，享年54岁。这一情节在游戏中通过剧情关卡和角色对话得以还原，成为玩家体验蜀汉后期历史的重要节点。
五丈原位于今陕西省宝鸡市岐山县境内，是连接关中与汉中的战略要地。游戏中通过地形设计和战场氛围营造，展现了这片古战场的险要地势。渭河南岸的高原环境与历史记载相符，玩家可在此处体验到诸葛亮北伐最后阶段的军事部署。游戏对五丈原的地理还原较为准确，包括其毗邻陈仓道、斜谷道等细节。
诸葛亮病逝五丈原的设定影响着蜀国阵营的后期发展。该事件触发后，玩家将面临蜀汉势力衰退的挑战，需要调整战略布局。游戏通过姜维继承遗志的剧情衔接，保持了历史连贯性。战斗系统中，五丈原关卡设计有特殊机制，例如粮草补给限制和天气变化，这些都与诸葛亮北伐的真实困境相呼应。
关于诸葛亮病逝的具体原因，游戏参考了三国志记载的积劳成疾说法。角色属性界面中的体力值设定与其历史形象吻合，长期征战导致的健康损耗会逐步降低角色战斗力。在五丈原剧情中，诸葛亮的面板数据会随时间推移持续衰减，最终触发病逝事件。这种设计既尊重史实，又增强了游戏代入感。
游戏对诸葛亮墓地的处理同样基于史实，采用陕西汉中勉县定军山的设定。虽然五丈原是病逝地点，但根据诸葛亮遗命葬汉中的记载，游戏中的纪念场景设在定军山。玩家完成相关主线任务后，可解锁武侯祠的特殊剧情。这种区分展现了开发团队对历史细节的考究，使游戏世界观更具可信度。
